Eftir nokkurn tíma geta vökvamótorar safnast fyrir ýmis konar óhreinindi og útfellingar sem geta haft áhrif á afköst þeirra og endingu. Þess vegna er nauðsynlegt að hreinsa vökvamótorinn tímanlega. Hins vegar ætti að hafa eftirfarandi atriði í huga við hreinsun:
1. Reglulega skipt um vökvaolíu getur dregið úr myndun óhreininda og útfellinga.
2. Notaðu faglega hreinsiefni og verkfæri.
3. Fyrir hreinsun þarf að taka vökvamótorinn í sundur og fjarlægja óhreinindi og ryk.
4. Forðist að nota vatn eða annan vökva við hreinsun, þar sem það getur skemmt vökvamótorinn.
